Bootloader Arduino adalah program atau firmware yang dimasukkan ke dalam microcontroller ATMEGA328P supaya boleh berfungsi seperti Arduino Uno. Jika ATMEGA328P tidak mempunyai bootloader, program hanya boleh dimasukkan melalui pin SPI. Hanya selepas bootloader dimasukkan, program boleh dimasukkan melalui pin UART atau serial.

Cara memasukkan bootloader ke dalam ATMEGA328P yang kosong adalah menggunakan arduino lain. Sambungan nya adalah seperti di bawah.

Kemudian masukkan program ArduinoISP yang diberikan di dalam Arduino IDE.

Setelah Arduino pertama berfungsi sebagai ArduinoISP, boleh memberi arahan untuk Burn Bootloader ke Arduino kedua.

Selepas beberapa ketika, masukkan bootloader selesai.